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read_cov_matrix.hpp
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1 #ifndef STAN_MATH_PRIM_MAT_FUN_READ_COV_MATRIX_HPP
2 #define STAN_MATH_PRIM_MAT_FUN_READ_COV_MATRIX_HPP
3
4 #include <stan/math/prim/mat/fun/read_cov_L.hpp>
5 #include <stan/math/prim/mat/fun/multiply_lower_tri_self_transpose.hpp>
6 #include <stan/math/prim/mat/fun/Eigen.hpp>
7
8 namespace stan {
9 namespace math {
10
20 template <typename T>
21 Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic>
22 read_cov_matrix(const Eigen::Array<T, Eigen::Dynamic, 1>& CPCs,
23 const Eigen::Array<T, Eigen::Dynamic, 1>& sds,
24 T& log_prob) {
25 Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> L
26 = read_cov_L(CPCs, sds, log_prob);
27 return multiply_lower_tri_self_transpose(L);
28 }
29
37 template<typename T>
38 Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic>
39 read_cov_matrix(const Eigen::Array<T, Eigen::Dynamic, 1>& CPCs,
40 const Eigen::Array<T, Eigen::Dynamic, 1>& sds) {
41 size_t K = sds.rows();
42 Eigen::DiagonalMatrix<T, Eigen::Dynamic> D(K);
43 D.diagonal() = sds;
44 Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic> L
45 = D * read_corr_L(CPCs, K);
46 return multiply_lower_tri_self_transpose(L);
47 }
48
49 }
50
51 }
52
53 #endif
stan::math::read_cov_matrix
Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > read_cov_matrix(const Eigen::Array< T, Eigen::Dynamic, 1 > &CPCs, const Eigen::Array< T, Eigen::Dynamic, 1 > &sds, T &log_prob)
A generally worse alternative to call prior to evaluating the density of an elliptical distribution...
Definition: read_cov_matrix.hpp:22
multiply_lower_tri_self_transpose.hpp
stan::math::read_cov_L
Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > read_cov_L(const Eigen::Array< T, Eigen::Dynamic, 1 > &CPCs, const Eigen::Array< T, Eigen::Dynamic, 1 > &sds, T &log_prob)
This is the function that should be called prior to evaluating the density of any elliptical distribu...
Definition: read_cov_L.hpp:22
stan
Definition: log_sum_exp.hpp:8
stan::math::multiply_lower_tri_self_transpose
Eigen::Matrix< fvar< T >, R, R > multiply_lower_tri_self_transpose(const Eigen::Matrix< fvar< T >, R, C > &m)
Definition: multiply_lower_tri_self_transpose.hpp:17
read_cov_L.hpp
Eigen.hpp
stan::math::read_corr_L
Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > read_corr_L(const Eigen::Array< T, Eigen::Dynamic, 1 > &CPCs, const size_t K)
Return the Cholesky factor of the correlation matrix of the specified dimensionality corresponding to...
Definition: read_corr_L.hpp:37

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